阿里继任哈里发，除叙利亚外，基本上得到了穆斯林的认可。

但阿里无视已发生的重大变化，试图恢复麦地那神权政体原则，撤销了奥斯曼的许多任命和决定，招致了一些新敌反对。

曾因凯觎哈里发职位而纵容反奥斯曼的阴谋活动的几个神权贵族人物脱勒哈、祖白尔和阿伊莎，现在打着为奥斯曼复仇的旗号，首先举兵反对他，占领了巴士拉。

　　656年12月9日阿里在巴士拉城外打败反叛联军，因战斗围绕着阿伊莎乘坐的驼轿进行，得名&ldo;骆驼之战&rdo;。

脱勒哈和祖白尔阵亡，阿伊莎被俘遣回麦地那。

这次战斗中许多圣门弟子丧生。

骆驼战役后阿里定新都于库法，但面临着危险的对手叙利亚总督穆阿维叶。

穆阿维叶具有杰出的政治才能，被公认为阿拉伯穆斯林的四位天才政治家之一。

他经营叙利亚20多年，拥有一支训练有素，长期与拜占庭作战的精良军队。

他拒绝向阿里任命的新总督移交权力，以惩办杀死奥斯曼的凶手为借口，不承认阿里的哈里发资格。

于是双方开始了隋

芬之战。

在657年7月26日的决战中，阿里军队占据优势。

此时阿慕尔献策，让叙利亚士兵枪挑《古兰经》，要求诉诸安拉仲裁。

阿里被主和派所迫，采取了同意仲裁的妥协态度。

659年1月，选派中立的阿布&iddot;穆萨为代表同穆阿维叶的代表，多谋善变的阿慕尔进行谈判，结果对阿里不利。

阿里拒绝接受裁决，但为时已晚。

军队内开始军心涣散，丧失攻势。

穆阿维叶乘机夺取埃及，并不断袭击伊拉克，阿里的处境日益危险。

阿里同意仲裁的妥协态度不仅使他贻误战机，而且带来了灾难性后果。

当时他部下的部分台米姆族虔信派战士，要求他拒绝仲裁，但遭到阿里拒绝。

于是，他们离开库法，脱离了阿里，这些人形成了伊斯兰教史上最早的教派，后称&ldo;哈瓦利吉派&rdo;（意为&ldo;出走者&rdo;）。

该派向往早期穆斯林的民主倾向，坚持哈里发的选举原则，激烈反对穆斯林上层新贵族。

哈瓦利吉派宣布废黜争夺哈里发职位的阿里和穆阿维叶。

659年7月阿里前去劝说他们归顺，结果变成一场拚杀，几乎将之全歼。

终未消失的哈瓦利吉派在以后的一个多世纪里频繁起义，对哈里发国家统治造成严重威胁。

661年1月24日晨，阿里在库法被复仇的哈瓦利吉派成员阿布杜&iddot;拉哈曼&iddot;伊本&iddot;穆勒介姆刺杀身亡。

阿里一死，他的军队迅速被穆阿维叶歼灭。

阿里党人在以后的发展中逐渐形成了伊斯兰教史上与正统逊尼派相对立的另一大教派什叶派。

从阿布&iddot;伯克尔至阿里的29年间在伊斯兰教史上称为&ldo;正统哈里发时期&rdo;。