麦克阿瑟一听就火了，他认为这又是海军搞的鬼，因而立即给马歇尔写信道：

菲律宾是美国的领地，我们的孤立无援的军队曾在那里被敌人消灭。

1700万菲律宾人显然仍然忠于美国，而由于我们未能支援和救济，他们正处于水深火热之中。

我们有义务去解救他们。

另外，如果美国故意绕过菲律宾，不尽最大努力去尽早营救我们的被俘者，侨民和忠诚的菲律宾人而任敌宰割，那就等于承认日本人关于美国人已抛弃菲律宾人，不愿让美国人流血去拯救他们的宣传是真实的；我们无疑将招致该民族的敌意；我们或许会在远东所有民族中丧失威信，从而在今后许多年内对美国产生不利的影响。

从信中看出，麦克阿瑟主要是从政治和情感上考虑先攻取菲律宾的重要性，参谋长联席会议的新方案，实际上将使他无从扮演&ldo;菲律宾的解放者&rdo;这一他非常想担任的角色。

他在信中最后说：

即使是从军事上考虑，绕过菲律宾直接攻取台湾也行不通，因为这一口咬得太大、太快了。

台湾的防御同腊包尔一样，固若金汤。

只有占领菲律宾才能为攻取台湾提供可依托的空军基地。

我清将军给我一次机会，允许我去华盛顿亲自向参谋长联席会议陈述我的观点。

然而，马歇尔却答复他道。

据报，日军正大力加强重要目标（贝劳、棉兰老等）的防御，进攻这些目标必然要付出高昂的代价，市且会使战局发展缓慢。

绕过菲律宾不等于放弃菲律宾，解放菲律宾和我们在那里的战俘的捷径是摧毁日本本上。

在重新夺取菲律宾的问题上，我们必须谨慎，不要让我们个人的感情和对菲律宾的政治考虑损害我们的远大目标。

我将向总统先生说明情况，以满足你向他陈述意见的愿望。

麦克阿瑟没有料到马歇尔并不支持他的意见，于是火气更大，索性我行我素，于7月初将他进攻菲律宾群岛的&ldo;滑膛枪手&rdo;计划提交到华盛顿。

该计划提出，他的部队将经福格尔科普半岛和莫罗太岛，在太平洋舰队的支援下，于10月25日在棉兰老岛登陆，11月15日在莱特岛登陆。

在占领莱特岛后，中太平洋部队将于1945年1月15日在吕宋岛北部登陆；西南太平洋部队于2月在吕宋岛东南部和民都洛岛登陆。

然后，西南太平洋部队在太平洋舰队的再次支援下绕过吕宋岛北面，他的6个师于1945年4月1日在林加延湾的东西两面登陆，并向马尼拉进军。

麦克阿瑟还向尼米兹通报了这个作战方案，征求他的意见。

尼米兹与麦克阿瑟一样，也反对参谋长联席会议的新方案，认为这过于冒险，步子太大也太快了，难以使陆基航空兵、陆军和海军部队同时参加进攻。

他指出，进攻日本比较有把握的路线还是沿着参谋长联席会议3月提出的计划打下去，那就是经菲律宾、台湾和琉球群岛向九州和本州推进。

但是，他对麦克阿瑟的作战计划也有保留意见，认为执行这个计划缺乏足够的空中支援力量，使作战时间拖得太长。